Treffen der Welt Top Virus Hunter


Ian Lipkin, weltbekannte Virus-Jäger, ist oft zu weit entfernten Ländern jetten – Länder in der Mitte des seltsamen Epidemien, das ist. Von SARS in China Mers in Saudi-Arabien hat sein Labor entdeckt oder mehr als 500 neue Viren zuvor geheimnisvoll auf den Menschen geprägt. Aber wie ist es arbeiten an vorderster Front einer Epidemie? Wie erkennen Sie einen Virus kann, den man nicht einmal sehen? Gizmodo kontaktierte Lipkin, einige Fragen über das Leben eines Virus-Jäger.

Lipkin hören reden, seine Forschung ist zu hören, im Wesentlichen eine Liste der wichtigsten viralen Krankheiten: HIV, West-Nil, SARS und So weiter. Aber fangen wir mit einem: MERS oder Nahen Osten respiratorisches Syndrom, die mysteriösen Lungenentzündung-ähnliche Krankheit, die brach in Saudi-Arabien im Jahr 2012 und hat seit 79 Leben behauptet. Letzte Woche veröffentlichte Co sein Labor an der Columbia University ein Papier in mBio mit weiterer Beweis, dass Kamele in der Verbreitung des MERS beteiligt sind.

Ian Lipkin mit der Schauspielerin Jennifer Ehle am Set von Ansteckung, wo er als wissenschaftlicher Berater war. Foto von Claudette Barius mit freundlicher Genehmigung von Warner Brothers.

Kamele und Nachtflüge: Studium MERS in Saudi Arabien

Verständlicherweise ist es schwierig, gefährliche Geheimnis Viren in den USA bringen, damit Lipkin seinem Labor nach Saudi Arabien gebracht.

Er und seine Kollegen entwickelte ein mobiles Labor, das passen genau 6 Stück aufgegebenes Gepäck (zwei für jede drei Teammitglieder gehen) und versendet nur ein Element, ein Roboter für die DNA- und RNA-Proben verwendet. Dann sie Shop eingerichtet – "wie jede alte Biologielabor solange Sie fließendes Wasser und Elektrizität," sagt Lipkin.

Mit dieser neuen mobilen Labors kann Lipkin Team schnell überall in der Welt eingerichtet. Nicht alles war perfekt in ihr die ersten Ausflug. Einer Maschine brach, und der schnellste Weg um es ersetzt wurde, einen Forscher, die alle der Weg zurück nach New York zu fliegen. "Wir trafen ihn am JFK-Flughafen mit einem Ersatz-Stück der Ausrüstung. Er hatte einen Bagel mit Räucherlachs und ein schwarz / weiß-Cookie und flog dann zurück nach Riyadh,"sagt Lipkin.

Die Studie Sequenzen übereinstimmenden MERS Virus in Saudi Arabien ein bucklig Kamele suchte und fand es allgegenwärtig, auch in Proben schon 1992. Die genetischen Sequenzen gefunden in Kamele abgestimmt auch die des infizierten Menschen.

Es können auch andere Tiere an der Übermittlung von MERS, beteiligt, aber das ist ziemlich überzeugende Beweise, die Kamele, die verwendet werden, für Milch, Fleisch und Rennen im Nahen Osten, spielen eine Rolle.

Lipkin (Mitte) mit der Schauspielerin Kate Winslet aus Ansteckung. Foto mit freundlicher Genehmigung von Candice Hoffman, CDC

Wie einen Virus zu identifizieren

Mit MERS, Lipkin Team war die Charakterisierung von eines Virus, das mit früheren Untersuchungen identifiziert worden waren, aber manchmal sind die Fragen noch grundlegende: Was ist das Virus die Ursache dieser Krankheit?

Lipkin identifiziert seinen ersten Virus, das Borna-Virus im Jahr 1990. Es dauerte ihm solide zweijähriger Arbeit bis 02:00 jeden Tag als er Ratten mit dem Borna-Virus infiziert ihre gesamte-DNA sequenziert und die Ratte Gene sorgfältig abgezogen, bis er nur die Gene des Borna Virus hatte. Identifizieren Sie das Borna-Virus heute? Es würde wahrscheinlich ein paar Stunden dauern.

Das ist dank teilweise zu neuen Techniken Lipkin und seine Kollegen haben am Anfang schnell verbesserte DNA-Sequenzierung Technologien entwickelt. Es gibt MassTag PCR, z. B. ein rapid-System zur Identifizierung von bekannter Viren. Hier ist jetzt es aus einem Artikel der New York Times funktioniert :

Die Forscher bereiten einen Cocktail von genetischem Material von 20 oder mehr Arten von Viren. Wenn sie die DNA von einer Probe zu diesem Cocktail mischen, werden die virale Segmente an keine übereinstimmenden DNA binden. Dr. Lipkin und seine Kollegen können dann Fisch, dazu passende Segmente durch eine Massen-Spektrometer zur Bestimmung ihrer Masse zu schießen. Aus diesen hinweisen können die Wissenschaftler oft bestimmen sie welche Art von Virus mit zu tun haben.

Wissenschaftler können für exotische und unbekannte Viren verwenden Sie eine höhere Tech-Version der Sequenz und subtrahieren Methode, Lipkin mit das Borna-Virus zu identifizieren. Natürlich, jetzt, es ist alles automatisiert, und Sie können alle Ihre Reagenzien aus dem Regal kaufen. Trotz der Herausforderungen der Arbeit mit mehr rudimentären Technik vor einem Vierteljahrhundert blickt Lipkin zurück auf die Borna Virus Entdeckung als einer der Höhepunkte seiner Karriere.

Bei 61 verbringt Lipkin mehr Zeit die Einrichtung internationaler Kooperationen als persönlich in diesen Tagen im Feld zu arbeiten. (Im Jahre 2003 erkrankte er nach Ausführung 10.000 SARS Test-Kits nach China zu einer Zeit, als niemand ins Land reisen wollte.) Er leitet jetzt Dutzende von Projekten über die Welt der Viren – von Geflügelbeständen im Irak zu einer Studie über Autismus und Infektion in Norwegen.

"Wenn Wissenschaftler glücklich sind, werden sie einen neuartiges Virus in ihrem ganzen Leben identifizieren," sagte Dr. Anthony S. Fauci, Direktor des National Institute of Allergy and Infectious Diseases, der New York Times. Für Lipkin ist es natürlich viel mehr als nur Glück arbeiten zu seinen Gunsten.

Top Bild mit freundlicher Genehmigung von Columbia University

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