Diese schwimmenden Labor kann sequenzieren DNA in Echtzeit, überall auf der Welt

Bis jetzt hat Sequenzierung der Genome von vielen marine Tierarten alle aber unmöglich, was die Notwendigkeit zu transportieren mit empfindlichere Proben Tausende von Meilen zurück zu einem irdischen Labor. Aber Dank dieser mobilen Genomics Übungseinheit erstellt von der University of Florida, werden die Forscher in der Lage, eine Probe DNA ohne Rückkehr in den Hafen laufen und erhalten ihre Daten in einer Angelegenheit von Stunden, nicht Tagen.

Untergebracht in einem nachgerüsteten Versand 20-Fuß-Container, integriert die seefahrenden genomische Lab UF Neurobiologe Leonid Moroz ersonnen einen handelsüblichen $50.000 Ion Torrent persönliche Genom Maschinensystem auf eine Nivellierung Benchtop, die es bei rauer See aufrecht halten können. Der Sequencer unterhält eine Satelliten-Uplink an der Universität HiPerGator Supercomputer, die die eigentlichen Daten Knirschen führt angeschlossen und kann vollständig sequenzieren eine Genom in einer Angelegenheit von Stunden vor zurück zu Forscher an Bord beamen.

Nicht nur, dass diese Methode drastisch erhöht Turnaround-Zeiten, es erlaubt Forschern, mehr zu tun mit weniger Exemplare. Konventionelle Sequenziermethoden erfordern mehrere Proben Proben für Sendungen zu beachten, die routinemäßig verloren gehen oder beschädigt in der Mail, eine Angelegenheit, die durch den raschen Abbau von die meisten marinen genetischem Material einmal seinen aus dem Wasser verschlimmert hat. Die on-Board-Methode beseitigt Versand Verluste bei gleichzeitiger Maximierung der Möglichkeit, genetische Wertstoffe zu sammeln.

Während ein paar von den letzten Test läuft erfolgreich übertragenen Daten an Bord ein UF Alaun 141-Fuß-Yacht, die Copasetic, Kran ladbaren Labor auf Tausende von Genen in 22 Organismen, einschließlich einige seltene Rippenquallen sind notorisch schwierig zu Biopsie und Probe.

Das Projekt erhielt Unterstützung von NASA, National Institutes of Health, der National Science Foundation und die Florida-Biodiversität-Institut. Moroz hofft auf eine Flotte von diesen modularen Labors zu entwickeln, die ausreichend große Schiff verladen werden können und senden sie an die entlegensten Ecken der Meere und beginnen die Jagd nach neuen Formen des Lebens.

Moroz sagte "Leben aus dem Meer kam", der AP, Erhaltung der Projektziele zu erklären. "Wir brauchen eine Manhattan-Projekt für die biologische Vielfalt. "Wir verlieren unser Erbe." Wir verlieren auch unzählige mögliche wissenschaftliche, pharmazeutische und industrielle Entdeckungen. Etwa die Hälfte aller neuer Wirkstoffe aus der Natur kommen konnten unerforschten Tiefen der Ozeane zig Millionen von nützlichen Verbindungen verstecken. Und es sei denn, wir einen Zug bekommen auf das Meer Bounty katalogisieren, bevor sie sich ändernden Bedingungen auf See vernichten, können wir nicht immer. [Reuters - UF - ABC]