Sequenzierung von DNA aus "Insekt Suppe" kann Erhaltung helfen

Es klingt nicht sehr appetitlich, aber eine Vielzahl von Krabbeltiere Brech- und Sequenzierung der DNS der daraus resultierenden "Insekt Suppe" möglicherweise eine effiziente Möglichkeit, Katalog Biodiversität und Naturschutz auf der ganzen Welt, laut einer neuen Studie zu verfolgen.

Der Prozess der Identifikation Spezies aus einem einzigen Gesamtprobe – püriert, Insekten, zum Beispiel – ist bekannt als "Metabarcoding." Forscher der University of East Anglia in Großbritannien sagen, dass Metabarcoding viel schneller und genauso zuverlässig wie kompilieren standard Biodiversität Datenbanken durch traditionelle aber arbeitsintensiver Mittel, wie die Entnahme von Proben aus einzelnen Insekten.

Metabarcoding wirksam zu überwachen, Artenschutz oder sich ändernde Umgebungen in verschiedenen Regionen, Ländern und Kontinenten ermöglichen könnte, sagen die Forscher.

"Jeder lebende Organismus enthält DNA, und sogar kleine Fragmente dieser DNA können verwendet werden, um Arten zu identifizieren" Studie leitende Autor Douglas Yu sagte in einer Erklärung. "Wir sammelten viele Insekten und andere Krabbeltiere, ground sie in ein"Insekt Suppe"und lesen Sie die DNA mit Sequenzern, die jetzt billig genug, um verwenden Sie wöchentlich oder sogar täglich." [Mikroskopischen Monster: Galerie der hässliche Bugs]

Traditionelle Methoden vs. metabarcoding

Yu und seine Kollegen ihre Ergebnisse im Vergleich mit Datensätzen, die in Großbritannien, China und Malaysia gesammelt. Die Datensätze in die traditionell kompilierte Datensätze mehr als 55.000 Exemplare identifiziert, die Forscher 2.505 in stundenlanger Arbeit, sagte Yu.

"Diese Art von Datensätzen sind der Goldstandard für die Biodiversitäts-monitoring aber sind so teuer, zu kompilieren, dass wir ihnen für die regelmäßige Überwachung verwenden können", erklärte er. "So sind Erhaltung Biologen und Umweltmanager gezwungen, mit wenig Informationen zu arbeiten."

Die Wissenschaftler verwendeten Metabarcoding um zu prüfen, ihre püriert-Up-Insekt-Suppe. Yu sagte, dass dieser Prozess die gleichen biologischen Vielfalt Informationen ergab, wie die eher traditionellen Datensätze. "sie sind auch umfassendere, viele Male schneller zu produzieren, weniger abhängig von taxonomischer Know-how, und sie haben den zusätzlichen Vorteil des Seins nachweisbar durch Dritte," fügte er hinzu.

Jede "Suppe" ausgeheckt von Yu und seine Kollegen vermischt miteinander Hunderte bis Tausende von Exemplaren mit Insektenfallen gefangen. Die Forscher sagten diese erfassten Fehler sind nur ein winziger Bruchteil der gesamten Bevölkerung und daher keine Bedenken über gefährdete Arten.

Abwehren vom Aussterben bedroht

Demonstrieren die Zuverlässigkeit der Metabarcoding könnte den Weg für die zukünftige Verwendung in shaping Umweltmanagement Entscheidungen und politische Ziele ebnen.

"Wenn die Umwelt zum besseren oder zum Schlechteren verändert, was in diesem Umfeld Veränderungen sowie lebt,", sagte Yu. "Insekt-Suppe wird eine empfindliche Thermometer für den Zustand der Natur." Zum Beispiel haben wir gezeigt, dass wenn der U.K. Forestry Commission einen Teil der grasbewachsenen Trackways, die laufen zwischen unserer Lebensräume bedrohter Heide [in den Niederungen von Großbritannien, die Heimat einiger bedroht oder hoch spezialisierte Pflanzen und Tiere sind], Populationen von seltenen Spinnen Pflüge, Käfer und andere Kriechtiere entlang dieser Trackways verbinden kann helfen zur Daube weg vom Aussterben bedroht."

Die Forscher arbeiten mit dem World Wildlife Fund und Wissenschaftler an der Universität Kopenhagen in Dänemark, die Metabarcoding verwenden, um Bloodsucking Blutegel, untersuchen deren DNA Spuren der bedrohten Säugetiere, die in den Regenwäldern in Vietnam und Laos Leben enthalten kann, sagte Yu.

"Durch die Schaffung einer"Blutegel-Suppe", können wir erhalten eine Liste der Säugetiere und erfahren Sie mehr über ob Park Erhaltung arbeitet," sagte er.

Die ausführlichen Ergebnisse der Studie wurden veröffentlicht online-5. August in der Zeitschrift Ecology Letters.

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