Pinie ergibt längste Genom sequenziert je
Wissenschaftler sagen, dass sie bis heute die längste Genomsequenz generiert haben, entwirren den genetischen Code der Weihrauch-Kiefer.
Nadelbäume gibt es schon seit der Zeit der Dinosaurier, und sie haben einige der größten Genome aller Lebewesen.
Im Südosten der USA heimisch, die Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda) kann über 100 Fuß (30 Meter) hoch und hat eine lange Genom zu 23 Milliarden Basenpaare entsprechen. Das ist mehr als sieben Mal so groß wie das menschliche Genom, verfügt über 3 Milliarden Basenpaare. (Diese Paare bilden Sequenzen, die Gene, die Zellen zu sagen, wie man Proteine genannt.)
"Es ist eine riesige Genom. Aber die Herausforderung ist nicht nur die Sequenzdaten sammeln. Das Problem dieser Sequenz in Reihenfolge zusammensetzen wird,", sagte Studie Forscher David Neale, Professor für Pflanzenwissenschaften an der University of California, Davis, in einer Erklärung.
Um dieses große genetische Rätsel zu vereinfachen, Neale und Kollegen montiert die meisten der Sequenz aus einem einzigen Pinienkern-einen haploiden Teil des Samens mit nur einem Satz der Chromosomen, zusammenzusetzen.
Die neue Forschung zeigte, dass Weihrauch-Genom mit sich wiederholenden DNA aufgebläht ist. In der Tat, sagen 82 Prozent des Genoms wiederholt, die Forscher.
Verständnis, dass die Loblolly Kiefer genetischen Code für verbesserte Zucht des Baumes, führen könnte, wird verwendet, um Papier und Holz machen und wird als eine potenzielle Biokraftstoff untersucht, sagen die Wissenschaftler.
Die Weihrauch-Kiefer schließt sich andere vor kurzem sequenzierten Koniferen, einschließlich die Gemeine Fichte (Picea Abies), hat 20 Milliarden Basenpaare. Für ihr nächstes Projekt sind die Forscher der Zucker-Kiefer, ein Baum mit 35 Milliarden Basenpaare betrachtete.
Die Forschung war diese Woche in den Zeitschriften Genetik und Biologie Genom detailliert.
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