Wissenschaftler Crowdsource genetischen Code der Asche Absterben Pilz zu entschlüsseln

Genetische Daten von infizierten Bäumen auf OpenAshDieback Website, um herauszufinden, Ursachen und beste Plan des Angriffs veröffentlicht werden

Britische Wissenschaftler versuchen, schlagen Asche Absterben Krankheit suchen die "Weisheit der vielen" um die Gene des Pilzes zu analysieren, die es verursacht.

Genetische Daten, die von infizierten Bäumen in Ashwellthorpe Holz in Norfolk werden veröffentlicht auf der Website von Sainsbury Laboratory am Freitag am neuen Standort OpenAshDieback, mit dem Ziel, herauszufinden, was den Pilz, der Absterben Angriff bewirkt, dass die Asche – und die besten Methoden macht, um zu stoppen oder verlangsamen ihre Ausbreitung.

Prof Sophien Kamoun, der Leiter des Sainsbury Laboratory, die gemeinsam mit John Innes Centre in Norfolk Arbeit sagte, dass wissenschaftliche Notfälle wie Asche Absterben Standardmethoden – wo ist Veröffentlichung begutachteten im geheimen und schließlich veröffentlicht-zu langsam, um nützlich zu sein.

"Ich habe ein Rind mit der Art und Weise, die Forschung in der Regel erfolgt," sagte Kamoun. "Wissenschaftler Sequenzierung des Genoms zu tun aber dann daran festhalten bis es offiziell veröffentlicht wird." Dies ist nicht im Notfall angemessen. Open Source das Verständnis der Daten auf diese Weise ist völlig angepasst auf das Alter des Internets."

Deutsche Wissenschaftler verwendeten Crowdsourcing im Jahr 2011 um zu versuchen, herauszufinden, die Herkunft eines Stammes von E-coli-Bakteriums, die 50 Menschen dort getötet. "Das das erste Mal, dass war versucht worden war, und es eine fantastische Erfahrung war bezeugen," sagte Kamoun.

Asche Absterben wird verursacht durch einen Pilz Chalara Fraxineagenannt und wurde zuerst in den 1990er Jahren auf dem europäischen Festland gekennzeichnet. Es wurde zuerst im Vereinigten Königreich in einer Gärtnerei Buckinghamshire im Februar entdeckt, und die neuesten Zahlen für seine Ausbreitung zeigen, dass innerhalb eines Monats, die Anzahl der Standorte, wo es festgestellt wurde, 291 verdoppelt hat.

"Mit Blick auf welche Gene werden in dieser Zeit des Jahres, wenn der Pilz im Holzgewebe Asche ausgedrückt, wir in der Lage sein zu Hause in auf Gene, die es ermöglichen, so schnell ausbreiten könnte", sagte Prof. Allan Downie von John Innes Centre, ein Institut strategisch gefördert durch die Biotechnologie und biologische Wissenschaften Research Council (BBSRC).

"Du musst deinen Feind kennen, bevor Sie beginnen können, Lösungen zu finden, und diese Arbeit es uns ermöglichen, das zu tun", sagte Dr. Joan Webber der Forestry Commission Forest Research Agency, die Forschungspartner im Projekt ist.

Kamoun vorgeschlagen, dass die Lösungen umfassen könnte zu finden, nahe Verwandte des Pilzes, die gefördert werden könnte, nicht infizierten Eschen zuerst zu kolonisieren oder Asche-Varianten, die genetisch geeignet, Giftstoffe aus dem Pilz zu widerstehen zu finden.

Mit Crowdsourcing bedeutet, dass das Team in der Lage, Know-how aus aller Welt zu verstehen, der Pilz Herkunft sowie seine Beziehung zu anderen Pilzen zu gewinnen werden. Mithilfe von Github, wodurch Änderungen an Dokumenten nachverfolgt werden, können die Beiträge von anderen Wissenschaftlern außerhalb der wichtigsten zwei Laboratorien zur Kenntnis genommen und in einer späteren Publikation zugeschrieben.